托木斯克足球俱乐部1992年开始参加俄罗斯国内的联赛，92年到97年球队一直参加俄罗斯国内的第3级别联赛。98年升入俄甲后，托木斯克一直有着稳定发挥，但始终于冲超失之交臂，02年和03年都获得了联赛的第3名。2004年球队众志成城，经过一个赛季的打拼他们终于完成冲超梦想。从2005年到2010年托木斯克在俄超并没有取得突出的战绩，始终处于联赛10名左右。 　　2013/14赛季球队的球衣赞助